В естественных условиях крокодилы становятся половозрелыми к пяти-семи годам. Самки откладывают яйца раз в один-два года. Яйца инкубируются в специально устроенных кучах разлагающегося растительного мусора, где температура находится на уровне 30-32 С. В зависимости от вида, а иногда и подвида крокодила, гнездо может представлять собой кучу растительных остатков вперемешку с землей или нору с гнездовой камерой, заполненной такой же смесью.

Постоянное разведение крокодилов - дело очень непростое. Например, в 1997 году из 120 зоопарков, содержащих миссисипского аллигатора (Alligator mississippiensis), только два имели успехи в разведении. Московский зоопарк несколько раз разводил сиамского крокодила (Crocodyllus siamensis), но эти разведения нерегулярны, несмотря на ежегодно получаемые кладки. Гораздо легче крокодилы размножаются в зоопарках, расположенных в климатических зонах, пригодных для содержания этих животных в открытых вольерах. Так из 14 зоопарков, содержащих гребнистого крокодила (Crocodylus porosus), регулярно разводит этот вид далеко не самый лучший Сайгонский зоопарк.

Крокодилы кроме зоопарков содержатся на фермах. Цель разведения - кожа, изделия из нее и в меньшей степени мясо. Объектом торговли является и молодняк. . Работа фермы строится следующим образом: существует постоянное поголовье производителей - много самок и несколько самцов; откладываемые ими яйца изымаются и инкубируются искусственно, полученный молодняк выращивается до определенных размеров и используется для получения кож. На крупных фермах Юго-Восточной Азии неизменной популярностью у туристов пользуются так называемые "крокодильи шоу". Зрелище впечатляющее, но оно несколько меркнет, когда знаешь, что у крокодилов, с которыми работают "дрессировщики", частично перерезаны мышцы, замыкающие челюсти. Все фермы расположены в зонах обитания крокодилов в природе, что снимает многие проблемы. В простейшем случае ферма представляет собой огороженный участок земли с природным или искусственным водоемом, разделенным на сектора, и техническими сооружениями, но существуют и очень сложные зоотехнические комплексы. На фермах разводят чаще всего виды, которые обитают в той же местности.